2. Relasi Stasiun Bandara YIA - Stasiun Yogyakarta Stasiun Bandara YIA - Stasiun Wates: Rp20.000 Stasiun Wates - Stasiun Yogyakarta: Rp10.000 Stasiun Bandara YIA - Stasiun Yogyakarta: Rp20.000 Pembelian tiket KA Bandara Yogyakarta dapat dilakukan secara online aplikasi KA Bandara yang bisa diunduh dari Play Store dan App Store. Di samping itu, tiket bisa pula diperoleh dari laman Reservasi KA Bandara di situs Railink.
Jadwal keberangkatan KA Bandara Yogyakarta Ada 28 perjalanan yang dilakukan KA Bandara Yogyakarta setiap harinya baik pergi atau pulang. Hampir setiap jamnya ada keberangkatan dari pagi sampai malam. Berikut jadwal keberangkat selengkapnya untuk Februari 2023:
1. Relasi Stasiun Yogyakarta - Stasiun Bandara YIA - Stasiun Yogyakarta: 04.35, 06:00, 07:20, 08:09, 08.59, 10:19, 10:55, 12.10, 12:55, 14:02, 14:56, 16:00, 16:55, 18:00, 19:00
- Stasiun Wates: 05:01, 06.26, 07:46, 08:35, 09.25, 10.45, 11:21, 12:36, 13:21, 14:28, 15:22, 16:26, 17:21, 18:26, 19:26
- Stasiun Bandara YIA: 05:14, 06:39, 07:59, 08:48, 09.38, 10:58, 11:34, 12.49, 13:34, 14:41, 15:35, 16:39, 17:34, 18:39, 19:39
2. Relasi Stasiun Bandara YIA
- Stasiun Yogyakarta - Stasiun Bandara YIA: 06:11, 07:21, 08:07, 09:25, 10:07, 11:10, 11:57, 13:08, 14:00, 15:10, 15:45, 16:49, 17:50, 19:15, 21:25 - Stasiun Wates: 06:26, 07:36, 08:22, 09:40, 10:22, 11:25, 12:12, 13:23, 14:15, 15:25, 16:00, 17:04, 18:05, 19:30, 21:40
- Stasiun Yogyakarta: 06:50, 08:00, 08:46, 10:04, 10:46, 11:49, 12:36, 13.47, 14.39, 15:49, 16:24,17:28, 18:29, 19:54, 22:04 (*)